• نشأ قسم تحفيظ القرآن الكريم بالقرار الوزاري رقم (29) مادة (17) لسنة 1994م.
• بدأ التعليم في مراكز تحفيظ القرآن الكريم بتلقين الطلاب سور القرآن الكريم اعتماداً على قدرة المدرس
في التلقين، ومن كان لا يستطيع القراءة فإنه يُعلم الهجاء من كتاب "القاعدة البغدادية"، وكانت فترة
الدوام ساعة ونصف عصراً لمدة أربعة أيام في الأسبوع.
• بعد القيام بدارسات ميدانية عن مستوى الطلاب والوقوف على ضعف ملحوظ في أدائهم ... قام قسم تحفيظ
القرآن الكريم بوضع خطة تعليمية شاملة لجميع فئات الطلاب قسمت على ثلاث مراحل (التمهيدية والتأسيسية
والمتوسطة والتكميلية) ثم قسّمت كل مرحلة إلى مستويات بحسب حفظ وعمر ومستوى الطالب.
• لعلاج مشكلة ضيق الوقت في مراكز التحفيظ، فتحت مراكز نموذجية يمتد وقتها من بعد صلاة العصر إلى أذان
العشاء ولمدة خمسة أيام في الأسبوع، كما فتحت الدراسة في الفترة الصباحية أيضاً.
• ومسايرةً للتطور الحاصل في وزارة الأوقاف والشؤون الإسلامية فقد رأى المسئولون في الوزارة توحيد
العمل في قسم تحفيظ القرآن الكريم ووضع لائحة فنية وإدارية موحدة تُعمم على جميع مراكز تحفيظ القرآن
الكريم وقد تحقق ذلك بفضل الله تعالى في شهر يناير من العام 2007م حيث تم إعادة تعيين وافتتاح مراكز
التحفيظ ووضعت لوائح نَظَّمت مراحل التعليم والدراسة في مراكز التحفيظ، كما نُظِّمت عملية التدريس
والإشراف والمتابعة والتحسين المستمر، ويتم فصلياً متابعة أداء جودة العمل، ويمكن الاطلاع على بعضها من
خلال هذا الموقع.
• نظام الاختبارات: كانت اختبارات الطلاب تقام نهاية كل عام من قبل لجنة تشكل بقرار من القسم، ثم تطور
الأمر وقسمت السنة إلى فصلين دراسيين، يختبر الطالب في نهاية كل فصل، ثم تم اقتراح تقسيم السنة إلى
أربعة فصول دراسية يتم فيها اختبار الطلاب في نهاية كل فصل دراسي، ثم آل الأمر إلى أن أصبح الاختبار
شهرياً وتم ربط مكافأة المدرس بمقدار ما يقدمه من جهد مع الطلاب وذلك حسب الاختبارات الشهرية التي تقام
للطلاب في المراكز، ثم تمّ اعتماد تقسيم السنة الى ثلاثة فصول دراسة يختبر الطالب نهاية كل فصل دراسي في
مستوى واحد كحد أدنى ويسمح له الزيادة إلى خمسة مستويات.
• صدر قرار سعادة وزير الأوقاف والشؤون الإسلامية رقم (24) لسنة (2011م) بإنشاء أقسام في الوحدات
الإدارية التي تتألف منها وزارة الأوقاف والشؤون الإسلامية ليتغير مسمى القسم من قسم تحفيظ القرآن
الكريم إلى قسم القرآن الكريم وعلومه.